در حکم خلیلی که مسئولیت ریاست شورای امر به معروف و نهی از منکر شرکت ملی نفت ایران را نیز به عهده دارد، اهم وظایف باقری را تشکیل شورا بر اساس مقررات مربوطه به معرفی اعضاء به شورای ستاد شرکت ملی نفت ایران و صدور احکام، اجرای مصوبات اعلام شده از سوی شورای ستاد شرکت ملی نفت ایران، فراگیر نمودن فریضتین با شناخت از شرکت متبوع و ارائه پیشنهادات به شورای ستاد شرکت ملی نفت ایران و اعلام گزارشات دوره ای از نتایج فعالیت ها به شورای ستاد شرکت ملی نفت ایران ابلاغ کرده اند.
در این حکم آمده است: امید است با اتکال به الطاف الهی بر اساس وظایف شرعی و سازمانی در راستای سیاست هایی که از سوی شورای ستاد امر به معروف و نهی از منکر شرکت ملی نفت ایران و در چارچوب مقررات ستاد احیای امر به معروف و نهی از منکر کشور اعلام و ابلاغ می گردد همکاری و اهتمام ویژه معمول نمایید.